flowchart TB
    subgraph " "
    v0["Channel.of"]
    v1["Channel.of"]
    v2["Channel.of"]
    end
    subgraph "PREPROCESS [PREPROCESS]"
    v3(["FASTQC"])
    v4(["TRIMGALORE"])
    end
    subgraph "ALIGNMENT [ALIGNMENT]"
    v5(["STAR_GENOMEGENERATE"])
    v7(["STAR_ALIGN"])
    v8(["SAMTOOLS_SORT"])
    v9(["SAMTOOLS_INDEX"])
    v6(( ))
    end
    subgraph " "
    v10["bai"]
    v17[" "]
    end
    subgraph "QUANTIFICATION [QUANTIFICATION]"
    v11(["SALMON_QUANT"])
    end
    v16(["MULTIQC"])
    v12(( ))
    v0 --> v3
    v0 --> v4
    v1 --> v5
    v2 --> v5
    v2 --> v11
    v3 --> v12
    v4 --> v7
    v4 --> v12
    v5 --> v6
    v6 --> v7
    v7 --> v8
    v7 --> v12
    v8 --> v9
    v8 --> v11
    v9 --> v10
    v11 --> v12
    v12 --> v16
    v16 --> v17
